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Stockage du lisier en France

9 Février 2026
Deux silos à lisier sur une exploitation agricole en France

Quelles sont les obligations réglementaires en 2026 ?

Le stockage du lisier et du digestat sont devenus un enjeu central pour les exploitations agricoles françaises. Entre l’allongement des périodes d’interdiction d’épandage, le développement rapide de la méthanisation et un contrôle réglementaire de plus en plus strict, les agriculteurs et les exploitant d’unités de méthanisation doivent aujourd’hui anticiper et sécuriser leur capacité de stockage.

Mais que faut-il réellement prévoir en 2026 ? Quelles sont les obligations à connaître pour rester conforme, éviter les sanctions et garantir la continuité de l’exploitation ?

Un cadre réglementaire de plus en plus exigeant

En France, le stockage du lisier est encadré par différentes réglementations visant à protéger les sols, les eaux et l’environnement. Ces règles ne sont pas nouvelles, mais leur application devient plus rigoureuse, notamment dans les régions à forte densité d’élevage et dans les projets liés à la méthanisation.

Concrètement, les exploitants doivent pouvoir démontrer que leurs installations permettent :

  • un stockage suffisant pendant les périodes d’interdiction d’épandage,
  • une étanchéité totale, sans infiltration dans le sol,
  • une gestion maîtrisée des volumes produits sur l’exploitation.

Des périodes d’épandage plus longues impliquent plus de capacité de stockage

L’un des principaux défis pour les agriculteurs concerne la durée croissante des périodes pendant lesquelles l’épandage est interdit. Dans de nombreuses régions françaises, cette période peut s’étendre sur quatre à cinq mois, notamment à l’automne et en hiver.

Cela signifie que la capacité de stockage doit être dimensionnée pour couvrir l’intégralité de cette période, sans dépendre de solutions temporaires ou non conformes. Les installations sous-dimensionnées ou improvisées sont de plus en plus exposées aux contrôles et aux sanctions.

Méthanisation : des exigences accrues pour le stockage du digestat

Le développement rapide des unités de méthanisation renforce encore les exigences en matière de stockage. Le digestat, issu de la production de biogaz, doit être stocké dans des conditions au moins équivalentes à celles du lisier.

Les exploitants de méthanisation doivent notamment garantir :

  • une capacité suffisante pour absorber les pics de production,
  • des installations durables et fiables sur le long terme,
  • une conformité irréprochable vis-à-vis des autorités et des partenaires énergétiques.

Le stockage devient ainsi un élément stratégique du bon fonctionnement d’un projet de méthanisation.

Autorisations, conformité et contrôles

Selon la nature, la taille et l’implantation des installations de stockage, différents régimes administratifs peuvent s’appliquer :

  • une déclaration préalable,
  • un permis ou une autorisation environnementale
  • des contrôles périodiques sur site.

Même lorsque les procédures sont plus simples que pour des ouvrages en béton permanents, la conformité technique reste indispensable. Lors des inspections, les autorités portent une attention particulière à la durabilité des matériaux, à l’étanchéité des structures et à la sécurité environnementale.

Anticiper pour sécuriser l’exploitation

À l’horizon 2026, la question ne sera plus de savoir s’il faut investir dans le stockage du lisier, mais de vérifier si les installations existantes sont réellement adaptées aux exigences actuelles et futures.

Anticiper permet d’éviter des investissements d’urgence, de sécuriser l’exploitation face aux contrôles et d’accompagner sereinement l’évolution de l’activité, qu’il s’agisse d’une augmentation du cheptel ou du développement de la méthanisation.

Conclusion : le stockage, un pilier de la pérennité agricole

Le stockage du lisier n’est plus une contrainte secondaire. Il constitue aujourd’hui un pilier de la conformité réglementaire et de la pérennité des exploitations agricoles françaises.

Face à des règles plus strictes, des volumes croissants et une surveillance renforcée, s’informer et anticiper devient essentiel pour travailler en toute sérénité et préparer l’avenir de son exploitation.

Herman Borkent
Votre spécialiste en agriculture
Herman Borkent
Responsable Commercial Agriculture Europe